V chráněné oblasti se nachází přes 20 chráněných území - přírodních rezervací, nalezišť a studijních ploch. Chráněna jsou především území s výskytem vzácných rostlin, rozsáhlá rašeliniště a původní bukové porosty. Za pozornost stojí celkový charakter Jizerských hor, který připomíná severskou přírodu.

Základní údaje o CHKO Jizerské hory
Rozloha: 368 km2
Zeměpisná poloha: 50° 42´ - 50° 56´ N, 15° 02 - 15° 23´ E
Nadmořská výška: 325 m (Raspenava) - 1124 m (Smrk)
Maloplošná zvláště chráněná území v CHKO:
- 3 národní přírodní rezervace
- 13 přírodních rezervací
- 10 přírodních památek

Dále jsou v působnosti Správy CHKO Jizerské hory Národní přírodní rezervace Karlovské bučiny, Národní přírodní památka Čertova zeď a Přírodní rezervace Hadí kopec.

Správa CHKO sídlí v budově nazývené Šolcův dům, která je jednou ze zachovaných památek lidové architektury přímo v centu Liberce.